K-Dense-AI/scientific-agent-skills

科学研究向けAIエージェント用に177個のスキルを提供し、実験設計から論文執筆まで対応するライブラリです。

開発の材料自由に使える · MITAI エージェントPython難易度
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デモ・公式サイトをひらくarxiv.org

中辛 の解説

Scientific Agent Skillsは、AIエージェントが科学研究タスクを自動実行するための177個のスキル集です。キレート化学スクリーニングから単一細胞RNA-seq解析、臨床試験設計まで、複数分野の作業流れを提供しており、各スキルはSKILL.mdに目的・手順・バージョン情報を記載しています。70以上の最適化されたPythonパッケージスキル、100以上の科学データベース、9個の統合プラットフォーム(Benchling・DNAnexusなど)、30以上の分析・コミュニケーション機能を備えています。npxコマンドまたはGitHub CLIで対応ホストに直接インストール可能で、バージョン2.72.0では文書処理スキル(docx・pdf・pptx・xlsx)をAnthropicのリポジトリに移行し、Scientific Slidesで新たにPowerPointデッキ生成機能を追加しています。設定後、エージェントはChEMBLクエリ・構造解析・仮想スクリーニング・文献検索・可視化を連鎖させた複雑な研究フローを単一プロンプトで実行できます。

こんなリポジトリです

こんなときに便利です

  • EGFR阻害剤候補の構造活性相関解析とChEMBLからのスクリーニング、DiffDockでの仮想スクリーニングにより、前臨床肺がん研究の化合物優先順位付け
  • 10X Genomicsデータの品質管理・二重細胞除去から、Cellxgene Census統計・PyDESeq2での差異発現解析、反応経路解析までの単一細胞RNA-seq全体フロー自動化

主な機能

177個の科学スキルと100以上の専門データベースへのアクセス機能70以上の最適化されたPythonパッケージスキルと標準化された科学的検証チェックCursor・Claude Code・Codex・Google Antigravityなど複数のAIエージェントホストへの対応

ほかとの違い

Agent Skills・Agent Plugins両方の開放標準に準拠し、単一エージェントに限定されず複数ホストで動作する点、および臨床試験・PK/PD・ISO 13485などの規制フレームワークに準拠した実装を備えている点が特徴です。

このリポジトリの作り方

はじめてですか? むずかしくありません — 上から順にたどれば、自分の環境で動かして味見できます。

準備するもの

  • Python 3.13以上
  • uvパッケージマネージャー
  • Agent Skills標準対応のAIエージェントホスト(Cursor、Claude Code、Codex、Google Antigravityなど)
  • macOS、Linux、またはWindows WSL2

すぐに始める

  1. uvパッケージマネージャーをインストールします(macOS/Linux)。
curl -LsSf https://astral.sh/uv/install.sh | sh
  1. 対応するAIエージェントホストで、npxコマンドでスキルをインストールします。
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
  1. または、GitHub CLIを使ってインストールする場合(v2.90.0以上)、以下を実行します。
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills
  1. 特定のスキル(例:scanpy)をターゲット指定してインストールできます。
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills scanpy
  1. エージェントホストを指定してインストールする場合。
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills --agent cursor
  1. インストール後、エージェントに研究タスクのプロンプトを入力すると、使用可能なスキルが自動的に実行されます。

ギット飯トライで味見

入れるのが面倒で少し不安だったなら — 安全スキャンからインストールまで、ターミナル一行で終わります。

ターミナルに貼り付ければ、ギット飯の安全スキャン → 隔離フォルダへ clone → インストール → 実行方法の案内まで自動です。はじめてでも大丈夫 — この一行だけです。

npx gitbap-try K-Dense-AI/scientific-agent-skills

Node.js さえあれば、インストールなしで動きます · ギット飯トライとは? →

スター推移 · 7日

48,042+750 / 7日

確認日時

使いやすさ · まねしやすいか

ベストサンプルサンプル評点 64/100
  • ゆるいライセンス
  • テストあり
  • サンプル集
  • 最近の更新
  • AGENTS.md
  • llms.txt
  • テンプレート

最近の更新あり · 2025 年に作成

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[![깃밥](https://www.gitbap.com/badge/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.svg)](https://www.gitbap.com/r/K-Dense-AI/scientific-agent-skills)
Claude からそのまま使う — ギット飯のつなぎ方

ギット飯を Claude につなぐと、こうしたリポジトリを Claude・Cursor・Codex から直接さがして試せます。

方法 ① コネクタ URL

Claude の設定 → コネクタにこのアドレスを貼り付け。

https://www.gitbap.com/api/mcp
方法 ② プラグイン(試用まで)

プラグインを入れると /gitbap-trending·/gitbap-try のスラッシュコマンドで、その場でリポジトリを試せます。Claude Code で下の 2 行を順に実行してください。

/plugin marketplace add jakeparkcolde/gitbap-cowork
/plugin install gitbap-cowork@gitbap
つなぎ方をくわしく →

AI が README をもとに要約しました · 原文を見る